I geni più studiati in Biologia: TP53 sul podio
Come ogni anno, il 2017 è stato ricco di classifiche di ogni genere e domande sui temi più disparati. Per quanto riguarda il mondo scientifico una domanda interessante è stata: quali sono stati i geni più popolari (ovvero piú studiati) fino ad oggi?
Ha risposto Elie Dolgin [1]. Da un suo recente articolo [2] ĆØ emerso che in circa 565ā000 articoli scientifici siano stati analizzati 27ā000 geni umani. Sulla base del numero di citazioni Ć© stata stilata la classifica dei geni piĆŗ studiati, che vede TP53, definito come āil guardiano del genomaā in testa con circa 8500 citazioni. Sul podio trovano posto anche TNF e EGFR.
- Ā Articolo redatto in collaborazione conĀ Luca Trotta.
Cosa determina la popolaritĆ di un gene rispetto ad altri?
La classifica ĆØ stata scritta sulla base del numero di citazioni per ogni gene, che riflette direttamente il numero di studi effettuati. Ma cosa determina effettivamente lĀ“interesse per un gene rispetto ad altri? Esistono criteri di āinteresse assolutoā o il numero di studi effettuato può dipendere anche da altri fattori?
Nel mondo scientifico si osservano spesso trends, con argomenti che raggiungono la notorietĆ anche tra i non addetti ai lavori. Questo processo puó essere determinato dalla rilevanza o impatto sulla societĆ dellāargomento in questione (evento/problema/scoperta), nonchĆ© da questioni mediatiche o socio-culturali, che non necessariamente trovano ragioni scientifiche.
Alcuni esempi?
A partire dagli anni ā70, con la crescente presa di coscienza del rischio ambientale, divenne popolare ai più il problema del progressivo assottigliamento dello strato di ozono localizzato nella stratosfera, per tutti comunemente noto come āil buco nellāozonoā. Lāattenzione sul problema ĆØ progressivamente diminuita, e non solo per il parziale miglioramento della situazione che si osserva ora [3]. La crescente attenzione su altri problemi relativi allāambiente (inquinamento, riscaldamento globale) ha ridotto la copertura mediatica e scientifica, e di conseguenza lĀ“interesse, per il buco dellĀ“ozono.
Nel campo medico, fino agli inizi degli anni ā80, le ricerche scientifiche erano prevalentemente concentrate sullāemoglobina e patologie ad essa connesse. A riguardo, Max Perutz, biologo austriaco, vinse il premio Nobel nel 1965 per aver determinato la struttura tridimensionale della proteina.
A fine anni ā80 lāAIDS fece la sua comparsa a livello mondiale, Ā rappresentando unāemergenza non solo di carattere sanitario ma anche sociale.
Un altro esempio ĆØ quello della ricerca genetica. A partire dai primi anni 2000, clonazione e ingegneria genetica diventarono āhot topicsā in vari ambiti e a vari livelli. Tutto iniziò con il Progetto Genoma Umano che sancƬ una nuova era per biologia, diretta verso la medicina di precisione [4]. Oltre allĀ“ingente rilevanza delle conquiste scientifiche, la genetica entrò nellāimmaginario collettivo per via del clamore delle questioni etico-sociali e degli scenari futuristici correlati.
La classifica completa
- TP53;
- TNF;
- EGFR;
- VEGFA;
- APOE;
- IL6;
- TGFB1;
- MTHFR;
- ESR1;
- AKT1.
TP53
Il primo posto nel āgreatest hitsā del genoma umano ĆØ occupato dal gene TP53, che codifica la proteina p53 presente sia nellāuomo e sia nel topo. Nel 1979 un gruppo di ricercatori dedusse un suo coinvolgimento nei processi di cancerogenesi sulla base delle alte concentrazioni in diversi tessuti tumorali. Il suo ruolo fu chiarito solo a partire dal 1989 [5]. Dieci anni dopo il gene TP53 fu sequenziato in campioni tumorali e furono rilevate una serie di mutazioni alla base dellāalterazione strutturale e funzionale della proteina. La successiva associazione tra mutazioni in TP53 e la sindrome di Li-Fraumeni confermò il ruolo del gene nella soppressione dei tumori [6].
TNF
Al secondo posto cāĆØ TNF, acronimo diāTumor Necrosis Factorā. Il suo nome deriva dalla capacitĆ della proteina di sopprimere le cellule cancerogene. TNF ĆØ una delle tre citochine pro-infiammatorie (insieme a IL-1 e IL-6), ed ĆØ prodotta dai macrofagi (con target lāepitelio vascolare) e dalle cellule Th1 (che stimolano lāattivazione dei macrofagi e la produzione di citochine pro-infiammatorie) [7].
EGFR
Al terzo postoĀ troviamo EGFR (āEpidermal Growth Factor Receptorā), appartenente ad una classe di recettori transmembrana a cui si legano i fattori di crescita allāesterno della cellula [8]. Sono determinanti nella genesi dei tumori tanto da rappresentare uno dei bersagli preferiti delle terapie anti-neoplastiche sviluppate soprattutto nellāultimo decennio[9].
Bibliografia
- www.eliedolgin.com
- āThe Greatest Hits of the Human Genomeā (Elie Dolgin).Nature, vol. 551, 23 novembre 2017.
- onlinelibrary.wiley.com/abstract
- biopills.net/la-medicina-di-precisione-verso-cure-personalizzate
- āThe rise of Tp53ā di Bert Vogelstein and Carol Prives su Nature Review Cancer e Molecular Biology in collaborazione con Roche.
- ghr.nlm.nih.gov/li-fraumeni-syndrome
- āMicrobiologia biomedica 3ā ā M.T.Madigan, J.M.Martino, D.A.Stahl, D.P.Clark, Brock ā Biologia dei Microrganismi, casa ed. Pearson (2012).
- ncbi.nlm.nih.gov/gene
- āFarmacologia generale molecolare ā Il meccanismo dāazione dei farmaciā di Clementi e Fumagalli, UTET.